鳐鱼内骨骼完全由软骨构成，有些部位钙化后也有一定的硬度，但不同于经过骨化形成的硬骨组织。体表披楯鳞，在发生上是由外胚层和中胚层共同形成；楯鳞和牙齿是同源结构。口的位置不在吻端而位于腹面，横裂（故称横口类）；偶鳍呈水平位；尾鳍为歪尾型。胃的分化明显，有独立的胰脏和发达的肝脏。肠内有螺旋瓣。无鳔。鳃间隔特长，延伸至体表与皮肤相连，因而鳃裂直接开口于体表。心脏具动脉圆锥。雄性的生殖管道借用中肾管。单一的泄殖腔孔开口于体外。雄性有交配器，称鳍脚。卵生，卵胎生或假胎生，体内受精，体外发育或体内发育。产卵量小，但成活率高。脑发达，比硬骨鱼还要高级。大脑体积大，大脑顶部也出现了神经物质。